Lorsque Taousert prend les rênes du pouvoir la monarchie traverse une grave crise et le trône est tiraillé entre, Siptah, le Chancelier Bay qui paraît, durant cette période, avoir joué un rôle décisif et elle. S'il est communément admis que la Reine gouverne au début l'Égypte avec l'aide du chancelier Bay, un document publié en 2000 par l'égyptologue Français Pierre Grandet montre que Bay aurait été exécuté sur les ordres de Siptah lors de l'an 5 de son règne. On a retrouvé dans la tombe de Bay des étiquettes de jarres attestant qu'il possédait des vignobles dans le Delta. Son influence et ses richesses trop importantes auraient-elles attisé convoitises ou jalousies ?. Le document étudié par Grandet est un ostracon en hiératique et si à sa lecture on est sur que l'ordre d'exécution vient bien du jeune Pharaon, aucune raison n'est donnée pour justifier ce qui le pousse à se retourner contre "le grand ennemi Bay".

   La seule petite preuve serait qu'en effet, le terme de "grand ennemi" dans les textes Égyptiens désignait bien une personne qui avait nuit à l'État et/ou au Pharaon lui même, mais de quelles manières ?. Le recto du document se lit ainsi : "Année 5, le 27e jour du IIIe mois de la saison Shemou. En ce jour, le scribe de la tombe de Paser est venu annoncer à Pharaon, la vie, la prospérité et la santé !, il a tué le grand ennemi Bay". Cette date est en accord avec la dernière apparition publique de Bay, que l'on date de l'an 4 du règne de Siptah. L'ostracon est essentiellement un arrêté royal pour les ouvriers de Deir el-Médineh. Il leur précisait de cesser tous travaux sur le tombeau de Bay (KV13) dans la vallée des Rois, qui avait été jugé comme un traître à l'État.

   Certains égyptologues, dont Pierre Grandet, pensent qu'il ne faut pas prendre pour acquit la première lecture du document, mais qu'il n'est peut-être que la transcription d'une situation qui fut détournée. Ils proposent une autre version des faits. Ce serait le clan des partisans de la Reine Taousert qui aurait fait tuer Bay, qui devenait trop important et gênant. Ils auraient ensuite lancé la rumeur que l'ordre venait de Pharaon. D'autres proposent que pour les mêmes raisons Siptah ait bel et bien tué Bay, de peur que celui-ci ne lui prenne le trône. Cela paraît pourtant peu probable, car dans ce cas il aurait du aussi s'en prendre à sa belle-mère qui était un réel successeur. Une troisième hypothèse semble plus plausible.

  Comme le précisent certains égyptologues, dont James Henry Breasted, lorsque l'on étudie le Papyrus Harris on y trouve un dénommé Iarsou (ou Yarsou ou Irsu), d'origine Syrienne (Sans que l'on en connaisse l'endroit exacte), qui aurait voulu profiter de cette période de trouble que traversait le pays pour s'emparer du trône, mais il aurait finalement été chassé. Ces chercheurs, pensent que Iarsou pourrait être Bay lui-même. Dans ce cas on comprend mieux sa disgrâce et l'accusation de "grand ennemi". Cependant il n'existe aucun document, ni aucune source sure pour confirmer telle ou telle théorie. Ce qui est certain c'est que cette disparition de Bay profitait clairement à la Reine puisqu'à peine un an plus tard, après la mort prématurée de Siptah, au cours de la 6e année de son règne (Il avait alors à peine 20 ans), Taousert lui succède comme Pharaon à part entière pendant 2/3 ans. Elle adopte un cartouche de couronnement sous le nom de Roi de : Satrê Méritamon "fille de Rê, Bien aimée d'Amon.

   Il est d'avis général que des expéditions furent menées au cours du règne de Taousert aux mines de turquoise dans le Sinaï et en Palestine. Un cartouche de la Reine provenant de Pi-Ramsès dans le Delta, a été trouvé et son nom y est associé aux mines du Sinaï. Des statues de Taousert ont été retrouvées :

- À Thèbes, la Reine est représentée avec Siptah assis sur ses genoux. La statue est aujourd'hui à la Glyptotek de Munich.

Sa sépulture

   Il est intéressant de noter que la Reine Taousert sera la seule femme avec Hatshepsout, à avoir possédé une tombe dans la vallée des Rois, ce qui prouve leur rang de Reine/Pharaon. Sa tombe, KV14, servira d'hypogée pour accueillir la momie de Sethnakht. Le tombeau fut cartographié pour la première fois en 1737-1738 par Richard Pococke, puis par James Burton en 1825. Les premières fouilles y furent faites par le Service des Antiquités en 1893-1895, puis par Hartwig Altenmüller de 1983-1987. Cette sépulture eut une histoire compliquée, Le tombeau fut commandé à la base par Séthi II (1203-1194), en l'an 2 de son règne, pour lui et pour la Reine, ce qui en soit était déjà quelque chose d'extraordinaire. La décoration initiale portait les cartouches du Roi. Puis Séthi II fit construire à nouveau pour lui la tombe KV15 où il fut enterré.

  Lorsque la Reine régna seule, après la mort prématuré de son beau-fils Siptah, qui fut enterré dans la tombe KV47, elle fit remplacer les cartouches de Séthi II par les siens et voulu achever la tombe pour son propre compte. Mais elle décéda avant la fin des travaux. Il furent repris et achevés par son successeur Sethnakht, qui usurpa la sépulture en l'agrandissant considérablement, pour en faire la plus grande tombe royale de la vallée, tandis que le sarcophage de la Reine fut réutilisé pour ré ensevelir Amonherkhepshef, fils de Ramsès II, dans la tombe KV13. La tombe s'étend sur une longueur totale d'un peu moins de 158,50 m.

  Selon certains spécialistes, elle aurait eut un fils avec Séthi II du nom de, Séthi-Mérenptah dont on perd rapidement la trace, mais qui meurt avant son père, ce serait pour cette raison que Siptah arriverait sur le trône. Cependant faute de plus amples preuves ce fait est contesté par certains égyptologues. Cyril Aldred, Aidan Marc Dodson et Dyan Hilton, pensent qu'une décoration de la tombe KV56 montrerait l'enterrement de leur fille (dont on ne connait pas le nom).